Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms