Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med29Q9DB91 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms