Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Prdm5Q9CXE0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Prdm5Q9CXE0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prdm5Q9CXE0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms