Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb2bQ9CWF2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubb2bQ9CWF2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb2bQ9CWF2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms