Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe41Q99PV5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bhlhe41Q99PV5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bhlhe41Q99PV5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms