Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim3Q99PE5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smim3Q99PE5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim3Q99PE5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms