Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcf2Q99LE6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcf2Q99LE6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcf2Q99LE6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms