Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y16

Pcdha3, Protocadherin alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha3Q91Y16 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha3Q91Y16 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdha3Q91Y16 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdha3Q91Y16 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms