Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4galnt3Q6L8S8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4galnt3Q6L8S8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
B4galnt3Q6L8S8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms