Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arhgap20Q6IFT4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arhgap20Q6IFT4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.8 ms