Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TroQ6DIC6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TroQ6DIC6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms