Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Myh1Q5SX40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myh1Q5SX40 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myh1Q5SX40 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myh1Q5SX40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms