Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fam35aQ3UEN2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam35aQ3UEN2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam35aQ3UEN2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms