Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MitfQ08874 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MitfQ08874 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MitfQ08874 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MitfQ08874 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MitfQ08874 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MitfQ08874 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MitfQ08874 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MitfQ08874 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MitfQ08874 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MitfQ08874 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms