Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 NQM1YGR043C 1002 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 SSY5YJL156C 2100 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 CPA1YOR303W 1236 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 SSZ1YHR064C 1617 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 HRP1YOL123W 1605 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 SNT2YGL131C 4212 nt4.41□□□□□ -1.7
YHP1Q04116 GCS1YDL226C 1059 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YGR022CYGR022C 330 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 SSP120YLR250W 705 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 TFB4YPR056W 1017 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 UBC4YBR082C 447 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 DED81YHR019C 1665 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 IME2YJL106W 1938 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 AAP1YHR047C 2571 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 VHS1YDR247W 1386 nt4.4□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 GUP2YPL189W 1830 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 RPT1YKL145W 1404 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 DON1YDR273W 1098 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 RPR2YIR015W 435 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YJL171CYJL171C 1191 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YJL193WYJL193W 1209 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 STE50YCL032W 1041 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 SET5YHR207C 1581 nt4.39□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 ALT1YLR089C 1779 nt4.38□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 VMA16YHR026W 642 nt4.38□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YKR041WYKR041W 753 nt4.38□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.38□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 MET8YBR213W 825 nt4.38□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 GEP3YOR205C 1671 nt4.38□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 DPH2YKL191W 1605 nt4.37□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 MRP17YKL003C 396 nt4.37□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 LST8YNL006W 912 nt4.37□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YNL108CYNL108C 813 nt4.37□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YPR195CYPR195C 330 nt4.37□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 NRD1YNL251C 1728 nt4.37□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 DAK1YML070W 1755 nt4.37□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 SLT2YHR030C 1455 nt4.37□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 QDR1YIL120W 1692 nt4.36□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YDL023CYDL023C 321 nt4.36□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YGL072CYGL072C 360 nt4.36□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 MTW1YAL034W-A 870 nt4.36□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YDR396WYDR396W 501 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 ARR3YPR201W 1215 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 MRPL36YBR122C 534 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 BRL1YHR036W 1416 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 FOL1YNL256W 2475 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YHR045WYHR045W 1683 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 VBA1YMR088C 1689 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 BRF1YGR246C 1791 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 UBX2YML013W 1755 nt4.35□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 BPL1YDL141W 2073 nt4.34□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 RNR3YIL066C 2610 nt4.34□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 RSC2YLR357W 2670 nt4.34□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 HAP1YLR256W 4509 nt4.34□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 RHB1YCR027C 630 nt4.34□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 SPG4YMR107W 348 nt4.34□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 YOR024WYOR024W 324 nt4.34□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 PIN2YOR104W 849 nt4.34□□□□□ -1.71
YHP1Q04116 ERG7YHR072W 2196 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 BIT2YBR270C 1638 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 ATE1YGL017W 1512 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 QRI1YDL103C 1434 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 YMR027WYMR027W 1413 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 YDL034WYDL034W 345 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 GIR2YDR152W 798 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 YLR296WYLR296W 327 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 SUE1YPR151C 621 nt4.33□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 ECM3YOR092W 1842 nt4.32□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 COX26YDR119W-A 201 nt4.32□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 YJL107CYJL107C 1164 nt4.32□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 COX17YLL009C 210 nt4.32□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 DCN1YLR128W 810 nt4.32□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 RPA49YNL248C 1248 nt4.32□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 RPS19BYNL302C 435 nt4.32□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 LEM3YNL323W 1245 nt4.32□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 MAK32YCR019W 1092 nt4.31□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.31□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 PRS1YKL181W 1284 nt4.31□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 SCO1YBR037C 888 nt4.31□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 VMS1YDR049W 1899 nt4.3□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 SRP101YDR292C 1866 nt4.3□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 ADY2YCR010C 852 nt4.3□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.3□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 EFM4YIL064W 774 nt4.3□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt4.3□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 PGU1YJR153W 1086 nt4.3□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 GPM3YOL056W 912 nt4.3□□□□□ -1.72
YHP1Q04116 RPO26YPR187W 468 nt4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 142.9 ms