Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vps45P97390 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps45P97390 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps45P97390 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vps45P97390 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps45P97390 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps45P97390 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms