Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccna2P51943 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccna2P51943 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccna2P51943 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms