Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxa11P31311 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxa11P31311 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa11P31311 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms