Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmga1P17095 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmga1P17095 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms