Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb1P13372 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms