Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem254aP0DN89 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem254aP0DN89 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem254aP0DN89 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem254aP0DN89 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmem254aP0DN89 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem254aP0DN89 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem254aP0DN89 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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