Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01738 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01738 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01738 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01738 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01738 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01738 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01738 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01738 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01738 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01738 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01738 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01738 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01738 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01738 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01738 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01738 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01738 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01738 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01738 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01738 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms