Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm17333C6EQI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm17333C6EQI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms