Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms