Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap4s1Q9WVL1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ap4s1Q9WVL1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap4s1Q9WVL1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap4s1Q9WVL1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap4s1Q9WVL1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap4s1Q9WVL1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap4s1Q9WVL1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap4s1Q9WVL1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap4s1Q9WVL1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap4s1Q9WVL1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap4s1Q9WVL1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap4s1Q9WVL1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap4s1Q9WVL1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap4s1Q9WVL1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ap4s1Q9WVL1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap4s1Q9WVL1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ap4s1Q9WVL1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ap4s1Q9WVL1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ap4s1Q9WVL1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ap4s1Q9WVL1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap4s1Q9WVL1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap4s1Q9WVL1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap4s1Q9WVL1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap4s1Q9WVL1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap4s1Q9WVL1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ap4s1Q9WVL1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ap4s1Q9WVL1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ap4s1Q9WVL1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap4s1Q9WVL1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ap4s1Q9WVL1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ap4s1Q9WVL1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ap4s1Q9WVL1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap4s1Q9WVL1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ap4s1Q9WVL1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap4s1Q9WVL1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ap4s1Q9WVL1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ap4s1Q9WVL1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap4s1Q9WVL1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap4s1Q9WVL1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ap4s1Q9WVL1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap4s1Q9WVL1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap4s1Q9WVL1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap4s1Q9WVL1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ap4s1Q9WVL1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap4s1Q9WVL1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ap4s1Q9WVL1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap4s1Q9WVL1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap4s1Q9WVL1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap4s1Q9WVL1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap4s1Q9WVL1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap4s1Q9WVL1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ap4s1Q9WVL1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap4s1Q9WVL1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap4s1Q9WVL1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ap4s1Q9WVL1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap4s1Q9WVL1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap4s1Q9WVL1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap4s1Q9WVL1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap4s1Q9WVL1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap4s1Q9WVL1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ap4s1Q9WVL1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap4s1Q9WVL1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap4s1Q9WVL1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap4s1Q9WVL1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ap4s1Q9WVL1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap4s1Q9WVL1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap4s1Q9WVL1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap4s1Q9WVL1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap4s1Q9WVL1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap4s1Q9WVL1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap4s1Q9WVL1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap4s1Q9WVL1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap4s1Q9WVL1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap4s1Q9WVL1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap4s1Q9WVL1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap4s1Q9WVL1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap4s1Q9WVL1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap4s1Q9WVL1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap4s1Q9WVL1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ap4s1Q9WVL1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap4s1Q9WVL1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap4s1Q9WVL1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap4s1Q9WVL1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ap4s1Q9WVL1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ap4s1Q9WVL1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap4s1Q9WVL1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap4s1Q9WVL1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms