Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Slit2Q9R1B9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Slit2Q9R1B9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Slit2Q9R1B9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Slit2Q9R1B9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Slit2Q9R1B9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Slit2Q9R1B9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Slit2Q9R1B9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Slit2Q9R1B9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Slit2Q9R1B9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Slit2Q9R1B9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Slit2Q9R1B9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Slit2Q9R1B9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Slit2Q9R1B9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Slit2Q9R1B9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Slit2Q9R1B9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Slit2Q9R1B9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Slit2Q9R1B9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Slit2Q9R1B9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Slit2Q9R1B9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Slit2Q9R1B9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Slit2Q9R1B9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Slit2Q9R1B9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Slit2Q9R1B9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Slit2Q9R1B9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Slit2Q9R1B9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Slit2Q9R1B9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Slit2Q9R1B9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Slit2Q9R1B9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Slit2Q9R1B9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Slit2Q9R1B9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Slit2Q9R1B9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Slit2Q9R1B9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Slit2Q9R1B9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Slit2Q9R1B9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Slit2Q9R1B9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Slit2Q9R1B9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Slit2Q9R1B9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
Slit2Q9R1B9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Slit2Q9R1B9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Slit2Q9R1B9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Slit2Q9R1B9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Slit2Q9R1B9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Slit2Q9R1B9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Slit2Q9R1B9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Slit2Q9R1B9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Slit2Q9R1B9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Slit2Q9R1B9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Slit2Q9R1B9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Slit2Q9R1B9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Slit2Q9R1B9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Slit2Q9R1B9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Slit2Q9R1B9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Slit2Q9R1B9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Slit2Q9R1B9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Slit2Q9R1B9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Slit2Q9R1B9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Slit2Q9R1B9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Slit2Q9R1B9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Slit2Q9R1B9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Slit2Q9R1B9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Slit2Q9R1B9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Slit2Q9R1B9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Slit2Q9R1B9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Slit2Q9R1B9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Slit2Q9R1B9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Slit2Q9R1B9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Slit2Q9R1B9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Slit2Q9R1B9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Slit2Q9R1B9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Slit2Q9R1B9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Slit2Q9R1B9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Slit2Q9R1B9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Slit2Q9R1B9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Slit2Q9R1B9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Slit2Q9R1B9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Slit2Q9R1B9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Slit2Q9R1B9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
Slit2Q9R1B9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Slit2Q9R1B9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Slit2Q9R1B9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Slit2Q9R1B9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Slit2Q9R1B9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Slit2Q9R1B9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Slit2Q9R1B9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Slit2Q9R1B9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Slit2Q9R1B9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Slit2Q9R1B9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Slit2Q9R1B9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Slit2Q9R1B9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Slit2Q9R1B9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Slit2Q9R1B9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Slit2Q9R1B9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Slit2Q9R1B9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Slit2Q9R1B9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Slit2Q9R1B9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Slit2Q9R1B9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Slit2Q9R1B9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Slit2Q9R1B9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Slit2Q9R1B9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms