Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
Lamc3Q9R0B6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Lamc3Q9R0B6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
Lamc3Q9R0B6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
Lamc3Q9R0B6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
Lamc3Q9R0B6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Lamc3Q9R0B6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Lamc3Q9R0B6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
Lamc3Q9R0B6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
Lamc3Q9R0B6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Lamc3Q9R0B6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Lamc3Q9R0B6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Lamc3Q9R0B6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC47.89■■■■■ 5.26
Lamc3Q9R0B6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
Lamc3Q9R0B6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Lamc3Q9R0B6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
Lamc3Q9R0B6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Lamc3Q9R0B6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
Lamc3Q9R0B6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
Lamc3Q9R0B6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Lamc3Q9R0B6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Lamc3Q9R0B6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
Lamc3Q9R0B6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Lamc3Q9R0B6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Lamc3Q9R0B6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Lamc3Q9R0B6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC47.42■■■■■ 5.18
Lamc3Q9R0B6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Lamc3Q9R0B6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Lamc3Q9R0B6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC47.37■■■■■ 5.17
Lamc3Q9R0B6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Lamc3Q9R0B6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
Lamc3Q9R0B6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
Lamc3Q9R0B6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Lamc3Q9R0B6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
Lamc3Q9R0B6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
Lamc3Q9R0B6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Lamc3Q9R0B6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Lamc3Q9R0B6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Lamc3Q9R0B6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Lamc3Q9R0B6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC47.09■■■■■ 5.13
Lamc3Q9R0B6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Lamc3Q9R0B6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Lamc3Q9R0B6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
Lamc3Q9R0B6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Lamc3Q9R0B6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Lamc3Q9R0B6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Lamc3Q9R0B6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
Lamc3Q9R0B6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
Lamc3Q9R0B6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Lamc3Q9R0B6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
Lamc3Q9R0B6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
Lamc3Q9R0B6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
Lamc3Q9R0B6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
Lamc3Q9R0B6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Lamc3Q9R0B6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
Lamc3Q9R0B6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Lamc3Q9R0B6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.08
Lamc3Q9R0B6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Lamc3Q9R0B6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
Lamc3Q9R0B6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Lamc3Q9R0B6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Lamc3Q9R0B6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Lamc3Q9R0B6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Lamc3Q9R0B6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Lamc3Q9R0B6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
Lamc3Q9R0B6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.41■■■■■ 5.02
Lamc3Q9R0B6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.01
Lamc3Q9R0B6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
Lamc3Q9R0B6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Lamc3Q9R0B6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
Lamc3Q9R0B6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Lamc3Q9R0B6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC46.26■■■■■ 5
Lamc3Q9R0B6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Lamc3Q9R0B6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Lamc3Q9R0B6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
Lamc3Q9R0B6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Lamc3Q9R0B6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC46.13■■■■■ 4.98
Lamc3Q9R0B6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Lamc3Q9R0B6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC46.12■■■■■ 4.97
Lamc3Q9R0B6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Lamc3Q9R0B6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
Lamc3Q9R0B6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Lamc3Q9R0B6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Lamc3Q9R0B6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
Lamc3Q9R0B6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
Lamc3Q9R0B6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Lamc3Q9R0B6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.02■■■■■ 4.96
Lamc3Q9R0B6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Lamc3Q9R0B6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Lamc3Q9R0B6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
Lamc3Q9R0B6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Lamc3Q9R0B6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Lamc3Q9R0B6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
Lamc3Q9R0B6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Lamc3Q9R0B6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Lamc3Q9R0B6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Lamc3Q9R0B6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Lamc3Q9R0B6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Lamc3Q9R0B6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
Lamc3Q9R0B6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms