Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Map1aQ9QYR6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Map1aQ9QYR6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Map1aQ9QYR6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Map1aQ9QYR6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Map1aQ9QYR6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Map1aQ9QYR6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Map1aQ9QYR6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Map1aQ9QYR6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Map1aQ9QYR6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map1aQ9QYR6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map1aQ9QYR6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map1aQ9QYR6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map1aQ9QYR6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Map1aQ9QYR6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Map1aQ9QYR6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Map1aQ9QYR6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Map1aQ9QYR6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Map1aQ9QYR6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map1aQ9QYR6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map1aQ9QYR6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Map1aQ9QYR6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map1aQ9QYR6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Map1aQ9QYR6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Map1aQ9QYR6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Map1aQ9QYR6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Map1aQ9QYR6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Map1aQ9QYR6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map1aQ9QYR6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map1aQ9QYR6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Map1aQ9QYR6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map1aQ9QYR6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Map1aQ9QYR6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Map1aQ9QYR6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Map1aQ9QYR6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Map1aQ9QYR6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map1aQ9QYR6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Map1aQ9QYR6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Map1aQ9QYR6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Map1aQ9QYR6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Map1aQ9QYR6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Map1aQ9QYR6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Map1aQ9QYR6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Map1aQ9QYR6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Map1aQ9QYR6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Map1aQ9QYR6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map1aQ9QYR6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map1aQ9QYR6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Map1aQ9QYR6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Map1aQ9QYR6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Map1aQ9QYR6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map1aQ9QYR6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map1aQ9QYR6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map1aQ9QYR6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map1aQ9QYR6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map1aQ9QYR6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Map1aQ9QYR6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Map1aQ9QYR6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Map1aQ9QYR6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Map1aQ9QYR6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Map1aQ9QYR6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Map1aQ9QYR6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Map1aQ9QYR6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Map1aQ9QYR6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Map1aQ9QYR6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Map1aQ9QYR6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Map1aQ9QYR6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Map1aQ9QYR6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map1aQ9QYR6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Map1aQ9QYR6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Map1aQ9QYR6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Map1aQ9QYR6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map1aQ9QYR6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Map1aQ9QYR6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Map1aQ9QYR6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map1aQ9QYR6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Map1aQ9QYR6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Map1aQ9QYR6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Map1aQ9QYR6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Map1aQ9QYR6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Map1aQ9QYR6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Map1aQ9QYR6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Map1aQ9QYR6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Map1aQ9QYR6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map1aQ9QYR6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map1aQ9QYR6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Map1aQ9QYR6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Map1aQ9QYR6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms