Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn15Q9JLG8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn15Q9JLG8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn15Q9JLG8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Capn15Q9JLG8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capn15Q9JLG8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capn15Q9JLG8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Capn15Q9JLG8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Capn15Q9JLG8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Capn15Q9JLG8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Capn15Q9JLG8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Capn15Q9JLG8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Capn15Q9JLG8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Capn15Q9JLG8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Capn15Q9JLG8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Capn15Q9JLG8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Capn15Q9JLG8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capn15Q9JLG8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capn15Q9JLG8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn15Q9JLG8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Capn15Q9JLG8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Capn15Q9JLG8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Capn15Q9JLG8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Capn15Q9JLG8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn15Q9JLG8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn15Q9JLG8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Capn15Q9JLG8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Capn15Q9JLG8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capn15Q9JLG8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Capn15Q9JLG8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Capn15Q9JLG8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Capn15Q9JLG8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Capn15Q9JLG8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Capn15Q9JLG8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capn15Q9JLG8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Capn15Q9JLG8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Capn15Q9JLG8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Capn15Q9JLG8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Capn15Q9JLG8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Capn15Q9JLG8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Capn15Q9JLG8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Capn15Q9JLG8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Capn15Q9JLG8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Capn15Q9JLG8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Capn15Q9JLG8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn15Q9JLG8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn15Q9JLG8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Capn15Q9JLG8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capn15Q9JLG8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Capn15Q9JLG8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Capn15Q9JLG8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn15Q9JLG8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn15Q9JLG8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Capn15Q9JLG8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Capn15Q9JLG8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Capn15Q9JLG8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Capn15Q9JLG8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn15Q9JLG8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Capn15Q9JLG8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Capn15Q9JLG8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Capn15Q9JLG8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn15Q9JLG8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn15Q9JLG8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Capn15Q9JLG8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Capn15Q9JLG8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capn15Q9JLG8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capn15Q9JLG8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn15Q9JLG8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn15Q9JLG8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn15Q9JLG8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capn15Q9JLG8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Capn15Q9JLG8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn15Q9JLG8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capn15Q9JLG8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capn15Q9JLG8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capn15Q9JLG8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Capn15Q9JLG8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Capn15Q9JLG8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Capn15Q9JLG8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Capn15Q9JLG8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Capn15Q9JLG8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Capn15Q9JLG8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Capn15Q9JLG8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Capn15Q9JLG8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Capn15Q9JLG8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Capn15Q9JLG8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Capn15Q9JLG8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Capn15Q9JLG8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Capn15Q9JLG8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Capn15Q9JLG8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capn15Q9JLG8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Capn15Q9JLG8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Capn15Q9JLG8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Capn15Q9JLG8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Capn15Q9JLG8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Capn15Q9JLG8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Capn15Q9JLG8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Capn15Q9JLG8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Capn15Q9JLG8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Capn15Q9JLG8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms