Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sorcs1Q9JLC4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sorcs1Q9JLC4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Sorcs1Q9JLC4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sorcs1Q9JLC4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sorcs1Q9JLC4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sorcs1Q9JLC4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sorcs1Q9JLC4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sorcs1Q9JLC4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sorcs1Q9JLC4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorcs1Q9JLC4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sorcs1Q9JLC4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sorcs1Q9JLC4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sorcs1Q9JLC4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sorcs1Q9JLC4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorcs1Q9JLC4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sorcs1Q9JLC4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sorcs1Q9JLC4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sorcs1Q9JLC4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sorcs1Q9JLC4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorcs1Q9JLC4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorcs1Q9JLC4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sorcs1Q9JLC4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sorcs1Q9JLC4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sorcs1Q9JLC4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sorcs1Q9JLC4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sorcs1Q9JLC4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorcs1Q9JLC4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sorcs1Q9JLC4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sorcs1Q9JLC4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sorcs1Q9JLC4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sorcs1Q9JLC4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorcs1Q9JLC4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorcs1Q9JLC4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorcs1Q9JLC4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorcs1Q9JLC4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sorcs1Q9JLC4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sorcs1Q9JLC4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sorcs1Q9JLC4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sorcs1Q9JLC4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sorcs1Q9JLC4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sorcs1Q9JLC4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorcs1Q9JLC4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorcs1Q9JLC4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sorcs1Q9JLC4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sorcs1Q9JLC4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorcs1Q9JLC4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sorcs1Q9JLC4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sorcs1Q9JLC4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sorcs1Q9JLC4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sorcs1Q9JLC4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sorcs1Q9JLC4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sorcs1Q9JLC4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sorcs1Q9JLC4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sorcs1Q9JLC4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sorcs1Q9JLC4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sorcs1Q9JLC4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sorcs1Q9JLC4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sorcs1Q9JLC4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sorcs1Q9JLC4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sorcs1Q9JLC4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sorcs1Q9JLC4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sorcs1Q9JLC4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sorcs1Q9JLC4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sorcs1Q9JLC4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sorcs1Q9JLC4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sorcs1Q9JLC4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sorcs1Q9JLC4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sorcs1Q9JLC4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sorcs1Q9JLC4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sorcs1Q9JLC4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sorcs1Q9JLC4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sorcs1Q9JLC4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sorcs1Q9JLC4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sorcs1Q9JLC4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sorcs1Q9JLC4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sorcs1Q9JLC4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorcs1Q9JLC4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sorcs1Q9JLC4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sorcs1Q9JLC4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sorcs1Q9JLC4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sorcs1Q9JLC4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sorcs1Q9JLC4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sorcs1Q9JLC4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sorcs1Q9JLC4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sorcs1Q9JLC4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sorcs1Q9JLC4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sorcs1Q9JLC4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sorcs1Q9JLC4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sorcs1Q9JLC4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sorcs1Q9JLC4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sorcs1Q9JLC4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sorcs1Q9JLC4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sorcs1Q9JLC4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sorcs1Q9JLC4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sorcs1Q9JLC4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sorcs1Q9JLC4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sorcs1Q9JLC4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sorcs1Q9JLC4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sorcs1Q9JLC4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms