Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmx1aQ9JKU8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmx1aQ9JKU8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmx1aQ9JKU8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmx1aQ9JKU8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmx1aQ9JKU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmx1aQ9JKU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmx1aQ9JKU8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmx1aQ9JKU8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmx1aQ9JKU8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmx1aQ9JKU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmx1aQ9JKU8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmx1aQ9JKU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmx1aQ9JKU8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmx1aQ9JKU8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmx1aQ9JKU8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmx1aQ9JKU8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmx1aQ9JKU8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmx1aQ9JKU8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmx1aQ9JKU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmx1aQ9JKU8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmx1aQ9JKU8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmx1aQ9JKU8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmx1aQ9JKU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmx1aQ9JKU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmx1aQ9JKU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmx1aQ9JKU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lmx1aQ9JKU8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lmx1aQ9JKU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmx1aQ9JKU8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmx1aQ9JKU8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmx1aQ9JKU8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmx1aQ9JKU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmx1aQ9JKU8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmx1aQ9JKU8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmx1aQ9JKU8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmx1aQ9JKU8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmx1aQ9JKU8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmx1aQ9JKU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmx1aQ9JKU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmx1aQ9JKU8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmx1aQ9JKU8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmx1aQ9JKU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmx1aQ9JKU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmx1aQ9JKU8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmx1aQ9JKU8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmx1aQ9JKU8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmx1aQ9JKU8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmx1aQ9JKU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmx1aQ9JKU8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmx1aQ9JKU8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmx1aQ9JKU8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lmx1aQ9JKU8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lmx1aQ9JKU8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmx1aQ9JKU8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmx1aQ9JKU8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmx1aQ9JKU8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lmx1aQ9JKU8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lmx1aQ9JKU8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lmx1aQ9JKU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Lmx1aQ9JKU8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lmx1aQ9JKU8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lmx1aQ9JKU8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lmx1aQ9JKU8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmx1aQ9JKU8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lmx1aQ9JKU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmx1aQ9JKU8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmx1aQ9JKU8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmx1aQ9JKU8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmx1aQ9JKU8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmx1aQ9JKU8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmx1aQ9JKU8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmx1aQ9JKU8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmx1aQ9JKU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmx1aQ9JKU8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmx1aQ9JKU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmx1aQ9JKU8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmx1aQ9JKU8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmx1aQ9JKU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmx1aQ9JKU8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmx1aQ9JKU8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmx1aQ9JKU8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmx1aQ9JKU8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmx1aQ9JKU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms