Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trem1Q9JKE2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trem1Q9JKE2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trem1Q9JKE2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trem1Q9JKE2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trem1Q9JKE2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trem1Q9JKE2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trem1Q9JKE2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trem1Q9JKE2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trem1Q9JKE2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trem1Q9JKE2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trem1Q9JKE2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trem1Q9JKE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trem1Q9JKE2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trem1Q9JKE2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trem1Q9JKE2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trem1Q9JKE2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trem1Q9JKE2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem1Q9JKE2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trem1Q9JKE2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trem1Q9JKE2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trem1Q9JKE2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trem1Q9JKE2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trem1Q9JKE2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trem1Q9JKE2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trem1Q9JKE2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trem1Q9JKE2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trem1Q9JKE2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trem1Q9JKE2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trem1Q9JKE2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trem1Q9JKE2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trem1Q9JKE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trem1Q9JKE2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trem1Q9JKE2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trem1Q9JKE2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trem1Q9JKE2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trem1Q9JKE2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trem1Q9JKE2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trem1Q9JKE2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trem1Q9JKE2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trem1Q9JKE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trem1Q9JKE2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trem1Q9JKE2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trem1Q9JKE2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trem1Q9JKE2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trem1Q9JKE2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trem1Q9JKE2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trem1Q9JKE2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trem1Q9JKE2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trem1Q9JKE2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trem1Q9JKE2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trem1Q9JKE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trem1Q9JKE2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trem1Q9JKE2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trem1Q9JKE2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trem1Q9JKE2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trem1Q9JKE2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trem1Q9JKE2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trem1Q9JKE2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trem1Q9JKE2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trem1Q9JKE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trem1Q9JKE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trem1Q9JKE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trem1Q9JKE2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trem1Q9JKE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trem1Q9JKE2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trem1Q9JKE2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trem1Q9JKE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trem1Q9JKE2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trem1Q9JKE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trem1Q9JKE2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trem1Q9JKE2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trem1Q9JKE2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trem1Q9JKE2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trem1Q9JKE2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trem1Q9JKE2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trem1Q9JKE2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trem1Q9JKE2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trem1Q9JKE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trem1Q9JKE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trem1Q9JKE2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trem1Q9JKE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trem1Q9JKE2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trem1Q9JKE2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trem1Q9JKE2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trem1Q9JKE2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trem1Q9JKE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trem1Q9JKE2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trem1Q9JKE2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trem1Q9JKE2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trem1Q9JKE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trem1Q9JKE2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trem1Q9JKE2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trem1Q9JKE2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trem1Q9JKE2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trem1Q9JKE2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trem1Q9JKE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trem1Q9JKE2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trem1Q9JKE2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms