Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacng3Q9JJV5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacng3Q9JJV5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cacng3Q9JJV5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cacng3Q9JJV5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cacng3Q9JJV5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cacng3Q9JJV5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacng3Q9JJV5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacng3Q9JJV5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacng3Q9JJV5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacng3Q9JJV5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacng3Q9JJV5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cacng3Q9JJV5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cacng3Q9JJV5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacng3Q9JJV5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacng3Q9JJV5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cacng3Q9JJV5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacng3Q9JJV5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacng3Q9JJV5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacng3Q9JJV5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cacng3Q9JJV5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacng3Q9JJV5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacng3Q9JJV5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cacng3Q9JJV5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cacng3Q9JJV5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacng3Q9JJV5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacng3Q9JJV5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cacng3Q9JJV5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacng3Q9JJV5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacng3Q9JJV5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cacng3Q9JJV5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacng3Q9JJV5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacng3Q9JJV5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacng3Q9JJV5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cacng3Q9JJV5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacng3Q9JJV5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacng3Q9JJV5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacng3Q9JJV5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacng3Q9JJV5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cacng3Q9JJV5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cacng3Q9JJV5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacng3Q9JJV5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cacng3Q9JJV5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cacng3Q9JJV5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacng3Q9JJV5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacng3Q9JJV5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacng3Q9JJV5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacng3Q9JJV5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacng3Q9JJV5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacng3Q9JJV5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cacng3Q9JJV5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacng3Q9JJV5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacng3Q9JJV5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cacng3Q9JJV5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacng3Q9JJV5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cacng3Q9JJV5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cacng3Q9JJV5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacng3Q9JJV5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacng3Q9JJV5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cacng3Q9JJV5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cacng3Q9JJV5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacng3Q9JJV5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cacng3Q9JJV5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacng3Q9JJV5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacng3Q9JJV5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacng3Q9JJV5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cacng3Q9JJV5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacng3Q9JJV5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cacng3Q9JJV5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Cacng3Q9JJV5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cacng3Q9JJV5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cacng3Q9JJV5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cacng3Q9JJV5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cacng3Q9JJV5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacng3Q9JJV5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacng3Q9JJV5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacng3Q9JJV5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacng3Q9JJV5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cacng3Q9JJV5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacng3Q9JJV5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacng3Q9JJV5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cacng3Q9JJV5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacng3Q9JJV5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacng3Q9JJV5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacng3Q9JJV5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacng3Q9JJV5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacng3Q9JJV5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacng3Q9JJV5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng3Q9JJV5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng3Q9JJV5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng3Q9JJV5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng3Q9JJV5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacng3Q9JJV5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacng3Q9JJV5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacng3Q9JJV5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacng3Q9JJV5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacng3Q9JJV5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacng3Q9JJV5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacng3Q9JJV5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacng3Q9JJV5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms