Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Actn2Q9JI91 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Actn2Q9JI91 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Actn2Q9JI91 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Actn2Q9JI91 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Actn2Q9JI91 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Actn2Q9JI91 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Actn2Q9JI91 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Actn2Q9JI91 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Actn2Q9JI91 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Actn2Q9JI91 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Actn2Q9JI91 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Actn2Q9JI91 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Actn2Q9JI91 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Actn2Q9JI91 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Actn2Q9JI91 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Actn2Q9JI91 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Actn2Q9JI91 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Actn2Q9JI91 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Actn2Q9JI91 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Actn2Q9JI91 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Actn2Q9JI91 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Actn2Q9JI91 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Actn2Q9JI91 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Actn2Q9JI91 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Actn2Q9JI91 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Actn2Q9JI91 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Actn2Q9JI91 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Actn2Q9JI91 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Actn2Q9JI91 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Actn2Q9JI91 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Actn2Q9JI91 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Actn2Q9JI91 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Actn2Q9JI91 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Actn2Q9JI91 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Actn2Q9JI91 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Actn2Q9JI91 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Actn2Q9JI91 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Actn2Q9JI91 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Actn2Q9JI91 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Actn2Q9JI91 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Actn2Q9JI91 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Actn2Q9JI91 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Actn2Q9JI91 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Actn2Q9JI91 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Actn2Q9JI91 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Actn2Q9JI91 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Actn2Q9JI91 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Actn2Q9JI91 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Actn2Q9JI91 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Actn2Q9JI91 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Actn2Q9JI91 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Actn2Q9JI91 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Actn2Q9JI91 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Actn2Q9JI91 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Actn2Q9JI91 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Actn2Q9JI91 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Actn2Q9JI91 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Actn2Q9JI91 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Actn2Q9JI91 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Actn2Q9JI91 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Actn2Q9JI91 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Actn2Q9JI91 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Actn2Q9JI91 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Actn2Q9JI91 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Actn2Q9JI91 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Actn2Q9JI91 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Actn2Q9JI91 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Actn2Q9JI91 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Actn2Q9JI91 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Actn2Q9JI91 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Actn2Q9JI91 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Actn2Q9JI91 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Actn2Q9JI91 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Actn2Q9JI91 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Actn2Q9JI91 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Actn2Q9JI91 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Actn2Q9JI91 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Actn2Q9JI91 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Actn2Q9JI91 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Actn2Q9JI91 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Actn2Q9JI91 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Actn2Q9JI91 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Actn2Q9JI91 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Actn2Q9JI91 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Actn2Q9JI91 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Actn2Q9JI91 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Actn2Q9JI91 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Actn2Q9JI91 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Actn2Q9JI91 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Actn2Q9JI91 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Actn2Q9JI91 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms