Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trim54Q9ERP3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Trim54Q9ERP3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Trim54Q9ERP3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trim54Q9ERP3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Trim54Q9ERP3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Trim54Q9ERP3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Trim54Q9ERP3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Trim54Q9ERP3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trim54Q9ERP3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trim54Q9ERP3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trim54Q9ERP3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trim54Q9ERP3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trim54Q9ERP3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Trim54Q9ERP3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trim54Q9ERP3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trim54Q9ERP3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trim54Q9ERP3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trim54Q9ERP3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trim54Q9ERP3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trim54Q9ERP3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Trim54Q9ERP3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim54Q9ERP3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim54Q9ERP3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trim54Q9ERP3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim54Q9ERP3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim54Q9ERP3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim54Q9ERP3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim54Q9ERP3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim54Q9ERP3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim54Q9ERP3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim54Q9ERP3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim54Q9ERP3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim54Q9ERP3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim54Q9ERP3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim54Q9ERP3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim54Q9ERP3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim54Q9ERP3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim54Q9ERP3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim54Q9ERP3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim54Q9ERP3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim54Q9ERP3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim54Q9ERP3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim54Q9ERP3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim54Q9ERP3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim54Q9ERP3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim54Q9ERP3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim54Q9ERP3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim54Q9ERP3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim54Q9ERP3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim54Q9ERP3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim54Q9ERP3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim54Q9ERP3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim54Q9ERP3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim54Q9ERP3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim54Q9ERP3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim54Q9ERP3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim54Q9ERP3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim54Q9ERP3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim54Q9ERP3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim54Q9ERP3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim54Q9ERP3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim54Q9ERP3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim54Q9ERP3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim54Q9ERP3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim54Q9ERP3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim54Q9ERP3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim54Q9ERP3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim54Q9ERP3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim54Q9ERP3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim54Q9ERP3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim54Q9ERP3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim54Q9ERP3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim54Q9ERP3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim54Q9ERP3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim54Q9ERP3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim54Q9ERP3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trim54Q9ERP3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim54Q9ERP3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim54Q9ERP3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim54Q9ERP3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim54Q9ERP3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim54Q9ERP3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim54Q9ERP3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim54Q9ERP3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim54Q9ERP3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim54Q9ERP3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim54Q9ERP3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim54Q9ERP3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim54Q9ERP3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms