Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Irx6Q9ER75 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Irx6Q9ER75 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Irx6Q9ER75 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Irx6Q9ER75 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Irx6Q9ER75 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Irx6Q9ER75 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Irx6Q9ER75 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Irx6Q9ER75 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Irx6Q9ER75 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Irx6Q9ER75 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Irx6Q9ER75 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Irx6Q9ER75 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Irx6Q9ER75 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Irx6Q9ER75 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Irx6Q9ER75 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Irx6Q9ER75 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Irx6Q9ER75 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Irx6Q9ER75 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Irx6Q9ER75 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Irx6Q9ER75 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Irx6Q9ER75 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Irx6Q9ER75 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Irx6Q9ER75 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Irx6Q9ER75 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Irx6Q9ER75 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Irx6Q9ER75 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Irx6Q9ER75 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Irx6Q9ER75 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Irx6Q9ER75 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Irx6Q9ER75 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Irx6Q9ER75 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Irx6Q9ER75 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Irx6Q9ER75 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Irx6Q9ER75 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Irx6Q9ER75 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Irx6Q9ER75 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Irx6Q9ER75 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Irx6Q9ER75 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Irx6Q9ER75 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Irx6Q9ER75 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Irx6Q9ER75 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Irx6Q9ER75 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Irx6Q9ER75 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Irx6Q9ER75 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Irx6Q9ER75 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Irx6Q9ER75 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Irx6Q9ER75 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Irx6Q9ER75 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Irx6Q9ER75 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Irx6Q9ER75 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Irx6Q9ER75 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Irx6Q9ER75 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Irx6Q9ER75 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Irx6Q9ER75 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Irx6Q9ER75 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Irx6Q9ER75 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Irx6Q9ER75 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Irx6Q9ER75 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Irx6Q9ER75 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Irx6Q9ER75 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Irx6Q9ER75 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Irx6Q9ER75 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Irx6Q9ER75 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Irx6Q9ER75 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Irx6Q9ER75 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Irx6Q9ER75 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Irx6Q9ER75 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Irx6Q9ER75 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Irx6Q9ER75 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Irx6Q9ER75 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Irx6Q9ER75 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Irx6Q9ER75 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Irx6Q9ER75 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Irx6Q9ER75 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Irx6Q9ER75 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Irx6Q9ER75 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Irx6Q9ER75 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Irx6Q9ER75 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Irx6Q9ER75 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Irx6Q9ER75 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Irx6Q9ER75 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Irx6Q9ER75 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Irx6Q9ER75 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Irx6Q9ER75 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Irx6Q9ER75 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Irx6Q9ER75 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Irx6Q9ER75 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Irx6Q9ER75 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Irx6Q9ER75 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Irx6Q9ER75 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Irx6Q9ER75 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Irx6Q9ER75 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Irx6Q9ER75 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Irx6Q9ER75 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Irx6Q9ER75 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms