Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAJ8

1700008P02Rik, MCG13911, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700008P02RikQ9DAJ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700008P02RikQ9DAJ8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700008P02RikQ9DAJ8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700008P02RikQ9DAJ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700008P02RikQ9DAJ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1700008P02RikQ9DAJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
1700008P02RikQ9DAJ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700008P02RikQ9DAJ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700008P02RikQ9DAJ8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700008P02RikQ9DAJ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700008P02RikQ9DAJ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700008P02RikQ9DAJ8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700008P02RikQ9DAJ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700008P02RikQ9DAJ8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700008P02RikQ9DAJ8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700008P02RikQ9DAJ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700008P02RikQ9DAJ8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700008P02RikQ9DAJ8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
1700008P02RikQ9DAJ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700008P02RikQ9DAJ8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700008P02RikQ9DAJ8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700008P02RikQ9DAJ8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
1700008P02RikQ9DAJ8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
1700008P02RikQ9DAJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
1700008P02RikQ9DAJ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700008P02RikQ9DAJ8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700008P02RikQ9DAJ8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1700008P02RikQ9DAJ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700008P02RikQ9DAJ8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
1700008P02RikQ9DAJ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700008P02RikQ9DAJ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700008P02RikQ9DAJ8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700008P02RikQ9DAJ8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700008P02RikQ9DAJ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700008P02RikQ9DAJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
1700008P02RikQ9DAJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700008P02RikQ9DAJ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700008P02RikQ9DAJ8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700008P02RikQ9DAJ8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1700008P02RikQ9DAJ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700008P02RikQ9DAJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700008P02RikQ9DAJ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700008P02RikQ9DAJ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700008P02RikQ9DAJ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700008P02RikQ9DAJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700008P02RikQ9DAJ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700008P02RikQ9DAJ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700008P02RikQ9DAJ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700008P02RikQ9DAJ8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700008P02RikQ9DAJ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700008P02RikQ9DAJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700008P02RikQ9DAJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700008P02RikQ9DAJ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700008P02RikQ9DAJ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700008P02RikQ9DAJ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700008P02RikQ9DAJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700008P02RikQ9DAJ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700008P02RikQ9DAJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700008P02RikQ9DAJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700008P02RikQ9DAJ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700008P02RikQ9DAJ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700008P02RikQ9DAJ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
1700008P02RikQ9DAJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700008P02RikQ9DAJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1700008P02RikQ9DAJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700008P02RikQ9DAJ8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700008P02RikQ9DAJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700008P02RikQ9DAJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700008P02RikQ9DAJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700008P02RikQ9DAJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700008P02RikQ9DAJ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700008P02RikQ9DAJ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms