Protein–RNA interactions for Protein: Q9D875

2010109A12Rik, MCG1041431, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109A12RikQ9D875 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
2010109A12RikQ9D875 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
2010109A12RikQ9D875 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
2010109A12RikQ9D875 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
2010109A12RikQ9D875 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
2010109A12RikQ9D875 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
2010109A12RikQ9D875 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
2010109A12RikQ9D875 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
2010109A12RikQ9D875 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
2010109A12RikQ9D875 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
2010109A12RikQ9D875 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
2010109A12RikQ9D875 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
2010109A12RikQ9D875 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
2010109A12RikQ9D875 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
2010109A12RikQ9D875 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
2010109A12RikQ9D875 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
2010109A12RikQ9D875 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
2010109A12RikQ9D875 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
2010109A12RikQ9D875 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27■■□□□ 1.91
2010109A12RikQ9D875 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
2010109A12RikQ9D875 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
2010109A12RikQ9D875 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
2010109A12RikQ9D875 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
2010109A12RikQ9D875 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
2010109A12RikQ9D875 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
2010109A12RikQ9D875 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
2010109A12RikQ9D875 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
2010109A12RikQ9D875 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
2010109A12RikQ9D875 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
2010109A12RikQ9D875 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
2010109A12RikQ9D875 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
2010109A12RikQ9D875 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
2010109A12RikQ9D875 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
2010109A12RikQ9D875 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
2010109A12RikQ9D875 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
2010109A12RikQ9D875 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
2010109A12RikQ9D875 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
2010109A12RikQ9D875 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
2010109A12RikQ9D875 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
2010109A12RikQ9D875 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
2010109A12RikQ9D875 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
2010109A12RikQ9D875 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
2010109A12RikQ9D875 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
2010109A12RikQ9D875 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
2010109A12RikQ9D875 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
2010109A12RikQ9D875 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
2010109A12RikQ9D875 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
2010109A12RikQ9D875 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
2010109A12RikQ9D875 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
2010109A12RikQ9D875 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
2010109A12RikQ9D875 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
2010109A12RikQ9D875 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
2010109A12RikQ9D875 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
2010109A12RikQ9D875 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
2010109A12RikQ9D875 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
2010109A12RikQ9D875 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
2010109A12RikQ9D875 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
2010109A12RikQ9D875 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
2010109A12RikQ9D875 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
2010109A12RikQ9D875 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
2010109A12RikQ9D875 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
2010109A12RikQ9D875 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
2010109A12RikQ9D875 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
2010109A12RikQ9D875 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
2010109A12RikQ9D875 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
2010109A12RikQ9D875 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
2010109A12RikQ9D875 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
2010109A12RikQ9D875 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
2010109A12RikQ9D875 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
2010109A12RikQ9D875 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
2010109A12RikQ9D875 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
2010109A12RikQ9D875 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
2010109A12RikQ9D875 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
2010109A12RikQ9D875 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
2010109A12RikQ9D875 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
2010109A12RikQ9D875 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
2010109A12RikQ9D875 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
2010109A12RikQ9D875 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
2010109A12RikQ9D875 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
2010109A12RikQ9D875 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
2010109A12RikQ9D875 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
2010109A12RikQ9D875 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
2010109A12RikQ9D875 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
2010109A12RikQ9D875 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
2010109A12RikQ9D875 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
2010109A12RikQ9D875 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
2010109A12RikQ9D875 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
2010109A12RikQ9D875 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
2010109A12RikQ9D875 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
2010109A12RikQ9D875 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
2010109A12RikQ9D875 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
2010109A12RikQ9D875 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms