Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atad1Q9D5T0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atad1Q9D5T0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atad1Q9D5T0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atad1Q9D5T0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atad1Q9D5T0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad1Q9D5T0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atad1Q9D5T0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atad1Q9D5T0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Atad1Q9D5T0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atad1Q9D5T0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atad1Q9D5T0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atad1Q9D5T0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atad1Q9D5T0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atad1Q9D5T0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atad1Q9D5T0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atad1Q9D5T0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atad1Q9D5T0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atad1Q9D5T0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atad1Q9D5T0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atad1Q9D5T0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atad1Q9D5T0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Atad1Q9D5T0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atad1Q9D5T0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atad1Q9D5T0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atad1Q9D5T0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atad1Q9D5T0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atad1Q9D5T0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atad1Q9D5T0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atad1Q9D5T0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atad1Q9D5T0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atad1Q9D5T0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atad1Q9D5T0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atad1Q9D5T0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atad1Q9D5T0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Atad1Q9D5T0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atad1Q9D5T0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Atad1Q9D5T0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atad1Q9D5T0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atad1Q9D5T0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atad1Q9D5T0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atad1Q9D5T0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atad1Q9D5T0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atad1Q9D5T0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atad1Q9D5T0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atad1Q9D5T0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atad1Q9D5T0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atad1Q9D5T0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atad1Q9D5T0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atad1Q9D5T0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atad1Q9D5T0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atad1Q9D5T0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atad1Q9D5T0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Atad1Q9D5T0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atad1Q9D5T0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atad1Q9D5T0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atad1Q9D5T0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atad1Q9D5T0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atad1Q9D5T0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atad1Q9D5T0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atad1Q9D5T0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atad1Q9D5T0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Atad1Q9D5T0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad1Q9D5T0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atad1Q9D5T0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atad1Q9D5T0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atad1Q9D5T0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atad1Q9D5T0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atad1Q9D5T0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atad1Q9D5T0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atad1Q9D5T0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Atad1Q9D5T0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atad1Q9D5T0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atad1Q9D5T0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atad1Q9D5T0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atad1Q9D5T0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Atad1Q9D5T0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atad1Q9D5T0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atad1Q9D5T0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atad1Q9D5T0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atad1Q9D5T0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atad1Q9D5T0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atad1Q9D5T0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atad1Q9D5T0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms