Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5M9

4930412O13Rik, MCG5020, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930412O13RikQ9D5M9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930412O13RikQ9D5M9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930412O13RikQ9D5M9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
4930412O13RikQ9D5M9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930412O13RikQ9D5M9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930412O13RikQ9D5M9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
4930412O13RikQ9D5M9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930412O13RikQ9D5M9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
4930412O13RikQ9D5M9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930412O13RikQ9D5M9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930412O13RikQ9D5M9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930412O13RikQ9D5M9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930412O13RikQ9D5M9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930412O13RikQ9D5M9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930412O13RikQ9D5M9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930412O13RikQ9D5M9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930412O13RikQ9D5M9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930412O13RikQ9D5M9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
4930412O13RikQ9D5M9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930412O13RikQ9D5M9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930412O13RikQ9D5M9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930412O13RikQ9D5M9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930412O13RikQ9D5M9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930412O13RikQ9D5M9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930412O13RikQ9D5M9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930412O13RikQ9D5M9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930412O13RikQ9D5M9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930412O13RikQ9D5M9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930412O13RikQ9D5M9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930412O13RikQ9D5M9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930412O13RikQ9D5M9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
4930412O13RikQ9D5M9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930412O13RikQ9D5M9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930412O13RikQ9D5M9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930412O13RikQ9D5M9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930412O13RikQ9D5M9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4930412O13RikQ9D5M9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930412O13RikQ9D5M9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930412O13RikQ9D5M9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930412O13RikQ9D5M9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930412O13RikQ9D5M9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930412O13RikQ9D5M9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930412O13RikQ9D5M9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930412O13RikQ9D5M9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930412O13RikQ9D5M9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930412O13RikQ9D5M9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930412O13RikQ9D5M9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930412O13RikQ9D5M9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930412O13RikQ9D5M9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930412O13RikQ9D5M9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930412O13RikQ9D5M9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930412O13RikQ9D5M9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930412O13RikQ9D5M9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930412O13RikQ9D5M9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
4930412O13RikQ9D5M9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930412O13RikQ9D5M9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930412O13RikQ9D5M9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930412O13RikQ9D5M9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930412O13RikQ9D5M9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930412O13RikQ9D5M9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930412O13RikQ9D5M9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930412O13RikQ9D5M9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930412O13RikQ9D5M9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
4930412O13RikQ9D5M9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930412O13RikQ9D5M9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930412O13RikQ9D5M9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930412O13RikQ9D5M9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
4930412O13RikQ9D5M9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930412O13RikQ9D5M9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930412O13RikQ9D5M9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930412O13RikQ9D5M9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930412O13RikQ9D5M9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930412O13RikQ9D5M9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930412O13RikQ9D5M9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
4930412O13RikQ9D5M9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4930412O13RikQ9D5M9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4930412O13RikQ9D5M9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930412O13RikQ9D5M9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930412O13RikQ9D5M9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930412O13RikQ9D5M9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930412O13RikQ9D5M9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930412O13RikQ9D5M9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930412O13RikQ9D5M9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
4930412O13RikQ9D5M9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
4930412O13RikQ9D5M9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930412O13RikQ9D5M9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930412O13RikQ9D5M9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930412O13RikQ9D5M9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930412O13RikQ9D5M9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930412O13RikQ9D5M9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
4930412O13RikQ9D5M9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930412O13RikQ9D5M9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
4930412O13RikQ9D5M9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930412O13RikQ9D5M9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930412O13RikQ9D5M9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930412O13RikQ9D5M9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930412O13RikQ9D5M9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930412O13RikQ9D5M9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930412O13RikQ9D5M9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930412O13RikQ9D5M9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms