Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5M9

4930412O13Rik, MCG5020, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930412O13RikQ9D5M9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
4930412O13RikQ9D5M9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
4930412O13RikQ9D5M9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
4930412O13RikQ9D5M9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
4930412O13RikQ9D5M9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
4930412O13RikQ9D5M9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
4930412O13RikQ9D5M9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
4930412O13RikQ9D5M9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930412O13RikQ9D5M9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930412O13RikQ9D5M9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
4930412O13RikQ9D5M9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
4930412O13RikQ9D5M9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
4930412O13RikQ9D5M9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4930412O13RikQ9D5M9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930412O13RikQ9D5M9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
4930412O13RikQ9D5M9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
4930412O13RikQ9D5M9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
4930412O13RikQ9D5M9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
4930412O13RikQ9D5M9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
4930412O13RikQ9D5M9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
4930412O13RikQ9D5M9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930412O13RikQ9D5M9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4930412O13RikQ9D5M9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
4930412O13RikQ9D5M9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930412O13RikQ9D5M9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930412O13RikQ9D5M9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
4930412O13RikQ9D5M9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
4930412O13RikQ9D5M9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4930412O13RikQ9D5M9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4930412O13RikQ9D5M9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
4930412O13RikQ9D5M9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930412O13RikQ9D5M9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4930412O13RikQ9D5M9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.55■■■□□ 2
4930412O13RikQ9D5M9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4930412O13RikQ9D5M9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930412O13RikQ9D5M9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930412O13RikQ9D5M9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930412O13RikQ9D5M9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930412O13RikQ9D5M9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930412O13RikQ9D5M9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930412O13RikQ9D5M9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930412O13RikQ9D5M9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930412O13RikQ9D5M9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
4930412O13RikQ9D5M9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
4930412O13RikQ9D5M9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
4930412O13RikQ9D5M9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930412O13RikQ9D5M9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
4930412O13RikQ9D5M9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
4930412O13RikQ9D5M9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
4930412O13RikQ9D5M9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4930412O13RikQ9D5M9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930412O13RikQ9D5M9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
4930412O13RikQ9D5M9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930412O13RikQ9D5M9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930412O13RikQ9D5M9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930412O13RikQ9D5M9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
4930412O13RikQ9D5M9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930412O13RikQ9D5M9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4930412O13RikQ9D5M9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4930412O13RikQ9D5M9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930412O13RikQ9D5M9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930412O13RikQ9D5M9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930412O13RikQ9D5M9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
4930412O13RikQ9D5M9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930412O13RikQ9D5M9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930412O13RikQ9D5M9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930412O13RikQ9D5M9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930412O13RikQ9D5M9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930412O13RikQ9D5M9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930412O13RikQ9D5M9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930412O13RikQ9D5M9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930412O13RikQ9D5M9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930412O13RikQ9D5M9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930412O13RikQ9D5M9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930412O13RikQ9D5M9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4930412O13RikQ9D5M9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930412O13RikQ9D5M9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930412O13RikQ9D5M9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930412O13RikQ9D5M9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
4930412O13RikQ9D5M9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930412O13RikQ9D5M9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4930412O13RikQ9D5M9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930412O13RikQ9D5M9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
4930412O13RikQ9D5M9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930412O13RikQ9D5M9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930412O13RikQ9D5M9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930412O13RikQ9D5M9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4930412O13RikQ9D5M9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930412O13RikQ9D5M9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930412O13RikQ9D5M9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930412O13RikQ9D5M9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930412O13RikQ9D5M9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
4930412O13RikQ9D5M9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930412O13RikQ9D5M9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930412O13RikQ9D5M9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930412O13RikQ9D5M9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930412O13RikQ9D5M9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930412O13RikQ9D5M9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
4930412O13RikQ9D5M9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930412O13RikQ9D5M9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms