Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Stag1Q9D3E6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Stag1Q9D3E6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Stag1Q9D3E6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Stag1Q9D3E6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Stag1Q9D3E6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Stag1Q9D3E6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Stag1Q9D3E6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Stag1Q9D3E6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Stag1Q9D3E6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Stag1Q9D3E6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Stag1Q9D3E6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Stag1Q9D3E6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Stag1Q9D3E6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Stag1Q9D3E6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Stag1Q9D3E6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Stag1Q9D3E6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Stag1Q9D3E6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Stag1Q9D3E6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Stag1Q9D3E6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Stag1Q9D3E6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Stag1Q9D3E6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Stag1Q9D3E6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Stag1Q9D3E6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Stag1Q9D3E6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Stag1Q9D3E6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Stag1Q9D3E6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Stag1Q9D3E6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Stag1Q9D3E6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Stag1Q9D3E6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Stag1Q9D3E6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Stag1Q9D3E6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Stag1Q9D3E6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Stag1Q9D3E6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Stag1Q9D3E6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Stag1Q9D3E6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Stag1Q9D3E6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Stag1Q9D3E6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Stag1Q9D3E6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Stag1Q9D3E6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Stag1Q9D3E6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Stag1Q9D3E6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Stag1Q9D3E6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Stag1Q9D3E6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Stag1Q9D3E6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Stag1Q9D3E6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Stag1Q9D3E6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Stag1Q9D3E6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Stag1Q9D3E6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Stag1Q9D3E6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Stag1Q9D3E6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Stag1Q9D3E6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Stag1Q9D3E6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Stag1Q9D3E6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Stag1Q9D3E6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Stag1Q9D3E6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Stag1Q9D3E6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Stag1Q9D3E6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Stag1Q9D3E6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Stag1Q9D3E6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Stag1Q9D3E6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Stag1Q9D3E6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Stag1Q9D3E6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Stag1Q9D3E6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Stag1Q9D3E6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Stag1Q9D3E6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Stag1Q9D3E6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Stag1Q9D3E6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Stag1Q9D3E6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Stag1Q9D3E6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Stag1Q9D3E6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Stag1Q9D3E6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Stag1Q9D3E6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Stag1Q9D3E6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Stag1Q9D3E6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Stag1Q9D3E6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Stag1Q9D3E6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Stag1Q9D3E6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Stag1Q9D3E6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Stag1Q9D3E6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Stag1Q9D3E6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stag1Q9D3E6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Stag1Q9D3E6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Stag1Q9D3E6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Stag1Q9D3E6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Stag1Q9D3E6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Stag1Q9D3E6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Stag1Q9D3E6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Stag1Q9D3E6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms