Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nol3Q9D1X0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nol3Q9D1X0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nol3Q9D1X0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nol3Q9D1X0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol3Q9D1X0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol3Q9D1X0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol3Q9D1X0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nol3Q9D1X0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nol3Q9D1X0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nol3Q9D1X0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nol3Q9D1X0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nol3Q9D1X0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nol3Q9D1X0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol3Q9D1X0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nol3Q9D1X0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nol3Q9D1X0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nol3Q9D1X0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nol3Q9D1X0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nol3Q9D1X0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nol3Q9D1X0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nol3Q9D1X0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nol3Q9D1X0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nol3Q9D1X0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nol3Q9D1X0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nol3Q9D1X0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nol3Q9D1X0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nol3Q9D1X0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nol3Q9D1X0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nol3Q9D1X0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nol3Q9D1X0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nol3Q9D1X0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nol3Q9D1X0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nol3Q9D1X0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nol3Q9D1X0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nol3Q9D1X0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nol3Q9D1X0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nol3Q9D1X0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nol3Q9D1X0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nol3Q9D1X0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nol3Q9D1X0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nol3Q9D1X0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nol3Q9D1X0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nol3Q9D1X0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol3Q9D1X0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol3Q9D1X0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol3Q9D1X0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol3Q9D1X0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol3Q9D1X0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol3Q9D1X0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol3Q9D1X0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol3Q9D1X0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol3Q9D1X0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol3Q9D1X0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol3Q9D1X0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nol3Q9D1X0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nol3Q9D1X0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nol3Q9D1X0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nol3Q9D1X0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nol3Q9D1X0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nol3Q9D1X0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nol3Q9D1X0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nol3Q9D1X0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nol3Q9D1X0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nol3Q9D1X0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms