Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf9Q9D0B0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf9Q9D0B0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf9Q9D0B0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf9Q9D0B0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Srsf9Q9D0B0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf9Q9D0B0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf9Q9D0B0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srsf9Q9D0B0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srsf9Q9D0B0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf9Q9D0B0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srsf9Q9D0B0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srsf9Q9D0B0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srsf9Q9D0B0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srsf9Q9D0B0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf9Q9D0B0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf9Q9D0B0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf9Q9D0B0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srsf9Q9D0B0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srsf9Q9D0B0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf9Q9D0B0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srsf9Q9D0B0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srsf9Q9D0B0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf9Q9D0B0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf9Q9D0B0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srsf9Q9D0B0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srsf9Q9D0B0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srsf9Q9D0B0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf9Q9D0B0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf9Q9D0B0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Srsf9Q9D0B0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Srsf9Q9D0B0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf9Q9D0B0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srsf9Q9D0B0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srsf9Q9D0B0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srsf9Q9D0B0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srsf9Q9D0B0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf9Q9D0B0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srsf9Q9D0B0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srsf9Q9D0B0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf9Q9D0B0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf9Q9D0B0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf9Q9D0B0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf9Q9D0B0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf9Q9D0B0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf9Q9D0B0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf9Q9D0B0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf9Q9D0B0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf9Q9D0B0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srsf9Q9D0B0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms