Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY9

Ndufc1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufc1Q9CQY9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ndufc1Q9CQY9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufc1Q9CQY9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ndufc1Q9CQY9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufc1Q9CQY9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ndufc1Q9CQY9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufc1Q9CQY9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ndufc1Q9CQY9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ndufc1Q9CQY9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufc1Q9CQY9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ndufc1Q9CQY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ndufc1Q9CQY9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ndufc1Q9CQY9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufc1Q9CQY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ndufc1Q9CQY9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufc1Q9CQY9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufc1Q9CQY9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufc1Q9CQY9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufc1Q9CQY9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufc1Q9CQY9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufc1Q9CQY9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufc1Q9CQY9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufc1Q9CQY9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufc1Q9CQY9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufc1Q9CQY9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufc1Q9CQY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufc1Q9CQY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufc1Q9CQY9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufc1Q9CQY9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ndufc1Q9CQY9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufc1Q9CQY9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufc1Q9CQY9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufc1Q9CQY9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufc1Q9CQY9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufc1Q9CQY9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufc1Q9CQY9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufc1Q9CQY9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufc1Q9CQY9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufc1Q9CQY9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufc1Q9CQY9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufc1Q9CQY9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufc1Q9CQY9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufc1Q9CQY9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufc1Q9CQY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufc1Q9CQY9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms