Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Chmp3Q9CQ10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Chmp3Q9CQ10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Chmp3Q9CQ10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chmp3Q9CQ10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Chmp3Q9CQ10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Chmp3Q9CQ10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Chmp3Q9CQ10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Chmp3Q9CQ10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chmp3Q9CQ10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chmp3Q9CQ10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Chmp3Q9CQ10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Chmp3Q9CQ10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Chmp3Q9CQ10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Chmp3Q9CQ10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Chmp3Q9CQ10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Chmp3Q9CQ10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Chmp3Q9CQ10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Chmp3Q9CQ10 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Chmp3Q9CQ10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Chmp3Q9CQ10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Chmp3Q9CQ10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chmp3Q9CQ10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Chmp3Q9CQ10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Chmp3Q9CQ10 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Chmp3Q9CQ10 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chmp3Q9CQ10 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Chmp3Q9CQ10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chmp3Q9CQ10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Chmp3Q9CQ10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Chmp3Q9CQ10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Chmp3Q9CQ10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Chmp3Q9CQ10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Chmp3Q9CQ10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chmp3Q9CQ10 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Chmp3Q9CQ10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Chmp3Q9CQ10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Chmp3Q9CQ10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Chmp3Q9CQ10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Chmp3Q9CQ10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Chmp3Q9CQ10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Chmp3Q9CQ10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Chmp3Q9CQ10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chmp3Q9CQ10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Chmp3Q9CQ10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chmp3Q9CQ10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Chmp3Q9CQ10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chmp3Q9CQ10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Chmp3Q9CQ10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Chmp3Q9CQ10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Chmp3Q9CQ10 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chmp3Q9CQ10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chmp3Q9CQ10 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Chmp3Q9CQ10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Chmp3Q9CQ10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Chmp3Q9CQ10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chmp3Q9CQ10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Chmp3Q9CQ10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chmp3Q9CQ10 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chmp3Q9CQ10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Chmp3Q9CQ10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Chmp3Q9CQ10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Chmp3Q9CQ10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Chmp3Q9CQ10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chmp3Q9CQ10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Chmp3Q9CQ10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chmp3Q9CQ10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Chmp3Q9CQ10 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Chmp3Q9CQ10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Chmp3Q9CQ10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chmp3Q9CQ10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chmp3Q9CQ10 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Chmp3Q9CQ10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Chmp3Q9CQ10 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Chmp3Q9CQ10 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Chmp3Q9CQ10 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Chmp3Q9CQ10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Chmp3Q9CQ10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Chmp3Q9CQ10 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chmp3Q9CQ10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Chmp3Q9CQ10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chmp3Q9CQ10 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Chmp3Q9CQ10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Chmp3Q9CQ10 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Chmp3Q9CQ10 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Chmp3Q9CQ10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Chmp3Q9CQ10 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Chmp3Q9CQ10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
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