Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Usp26Q99MX1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp26Q99MX1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Usp26Q99MX1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp26Q99MX1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Usp26Q99MX1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Usp26Q99MX1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp26Q99MX1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Usp26Q99MX1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Usp26Q99MX1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Usp26Q99MX1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Usp26Q99MX1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Usp26Q99MX1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp26Q99MX1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Usp26Q99MX1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp26Q99MX1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Usp26Q99MX1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp26Q99MX1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Usp26Q99MX1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Usp26Q99MX1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Usp26Q99MX1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Usp26Q99MX1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp26Q99MX1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Usp26Q99MX1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Usp26Q99MX1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Usp26Q99MX1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Usp26Q99MX1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp26Q99MX1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp26Q99MX1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp26Q99MX1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp26Q99MX1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Usp26Q99MX1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Usp26Q99MX1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp26Q99MX1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp26Q99MX1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp26Q99MX1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Usp26Q99MX1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Usp26Q99MX1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp26Q99MX1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp26Q99MX1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Usp26Q99MX1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Usp26Q99MX1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp26Q99MX1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp26Q99MX1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Usp26Q99MX1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp26Q99MX1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Usp26Q99MX1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Usp26Q99MX1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Usp26Q99MX1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Usp26Q99MX1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Usp26Q99MX1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Usp26Q99MX1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Usp26Q99MX1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Usp26Q99MX1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Usp26Q99MX1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Usp26Q99MX1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Usp26Q99MX1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp26Q99MX1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp26Q99MX1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp26Q99MX1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp26Q99MX1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp26Q99MX1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp26Q99MX1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Usp26Q99MX1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp26Q99MX1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Usp26Q99MX1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp26Q99MX1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp26Q99MX1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp26Q99MX1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp26Q99MX1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp26Q99MX1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp26Q99MX1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp26Q99MX1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Usp26Q99MX1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Usp26Q99MX1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp26Q99MX1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp26Q99MX1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp26Q99MX1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp26Q99MX1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp26Q99MX1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp26Q99MX1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp26Q99MX1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp26Q99MX1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Usp26Q99MX1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp26Q99MX1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp26Q99MX1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Usp26Q99MX1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Usp26Q99MX1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp26Q99MX1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp26Q99MX1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp26Q99MX1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp26Q99MX1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp26Q99MX1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp26Q99MX1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Usp26Q99MX1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp26Q99MX1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp26Q99MX1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp26Q99MX1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp26Q99MX1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp26Q99MX1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms