Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarcd2Q99JR8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarcd2Q99JR8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarcd2Q99JR8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarcd2Q99JR8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarcd2Q99JR8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarcd2Q99JR8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smarcd2Q99JR8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarcd2Q99JR8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Smarcd2Q99JR8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Smarcd2Q99JR8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smarcd2Q99JR8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smarcd2Q99JR8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smarcd2Q99JR8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarcd2Q99JR8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarcd2Q99JR8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarcd2Q99JR8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarcd2Q99JR8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smarcd2Q99JR8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smarcd2Q99JR8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smarcd2Q99JR8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarcd2Q99JR8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarcd2Q99JR8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarcd2Q99JR8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarcd2Q99JR8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarcd2Q99JR8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarcd2Q99JR8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarcd2Q99JR8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarcd2Q99JR8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarcd2Q99JR8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarcd2Q99JR8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarcd2Q99JR8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarcd2Q99JR8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarcd2Q99JR8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcd2Q99JR8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarcd2Q99JR8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarcd2Q99JR8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarcd2Q99JR8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarcd2Q99JR8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarcd2Q99JR8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarcd2Q99JR8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarcd2Q99JR8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarcd2Q99JR8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarcd2Q99JR8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarcd2Q99JR8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarcd2Q99JR8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarcd2Q99JR8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcd2Q99JR8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarcd2Q99JR8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarcd2Q99JR8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarcd2Q99JR8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarcd2Q99JR8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarcd2Q99JR8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarcd2Q99JR8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarcd2Q99JR8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarcd2Q99JR8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarcd2Q99JR8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarcd2Q99JR8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarcd2Q99JR8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarcd2Q99JR8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarcd2Q99JR8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarcd2Q99JR8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarcd2Q99JR8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarcd2Q99JR8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarcd2Q99JR8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarcd2Q99JR8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarcd2Q99JR8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcd2Q99JR8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarcd2Q99JR8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarcd2Q99JR8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarcd2Q99JR8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcd2Q99JR8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcd2Q99JR8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcd2Q99JR8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smarcd2Q99JR8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcd2Q99JR8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcd2Q99JR8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcd2Q99JR8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarcd2Q99JR8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcd2Q99JR8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcd2Q99JR8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarcd2Q99JR8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcd2Q99JR8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcd2Q99JR8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcd2Q99JR8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcd2Q99JR8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcd2Q99JR8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcd2Q99JR8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarcd2Q99JR8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcd2Q99JR8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcd2Q99JR8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarcd2Q99JR8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms