Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TardbpQ921F2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TardbpQ921F2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TardbpQ921F2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TardbpQ921F2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TardbpQ921F2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TardbpQ921F2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TardbpQ921F2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TardbpQ921F2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TardbpQ921F2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TardbpQ921F2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TardbpQ921F2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TardbpQ921F2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TardbpQ921F2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TardbpQ921F2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TardbpQ921F2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TardbpQ921F2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TardbpQ921F2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TardbpQ921F2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TardbpQ921F2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TardbpQ921F2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TardbpQ921F2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TardbpQ921F2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TardbpQ921F2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TardbpQ921F2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TardbpQ921F2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TardbpQ921F2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TardbpQ921F2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TardbpQ921F2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TardbpQ921F2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TardbpQ921F2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TardbpQ921F2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TardbpQ921F2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TardbpQ921F2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TardbpQ921F2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TardbpQ921F2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TardbpQ921F2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TardbpQ921F2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TardbpQ921F2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TardbpQ921F2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TardbpQ921F2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TardbpQ921F2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TardbpQ921F2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TardbpQ921F2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TardbpQ921F2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TardbpQ921F2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TardbpQ921F2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TardbpQ921F2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TardbpQ921F2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TardbpQ921F2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TardbpQ921F2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TardbpQ921F2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TardbpQ921F2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TardbpQ921F2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TardbpQ921F2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TardbpQ921F2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TardbpQ921F2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TardbpQ921F2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TardbpQ921F2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TardbpQ921F2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TardbpQ921F2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TardbpQ921F2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TardbpQ921F2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TardbpQ921F2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TardbpQ921F2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TardbpQ921F2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TardbpQ921F2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TardbpQ921F2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TardbpQ921F2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TardbpQ921F2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TardbpQ921F2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TardbpQ921F2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TardbpQ921F2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TardbpQ921F2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TardbpQ921F2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TardbpQ921F2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TardbpQ921F2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TardbpQ921F2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TardbpQ921F2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TardbpQ921F2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TardbpQ921F2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms