Protein–RNA interactions for Protein: Q920R0

Als2, Alsin, mousemouse

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2Q920R0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Als2Q920R0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Als2Q920R0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Als2Q920R0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Als2Q920R0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Als2Q920R0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Als2Q920R0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Als2Q920R0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Als2Q920R0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Als2Q920R0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Als2Q920R0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Als2Q920R0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Als2Q920R0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Als2Q920R0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Als2Q920R0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Als2Q920R0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Als2Q920R0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Als2Q920R0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Als2Q920R0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Als2Q920R0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Als2Q920R0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Als2Q920R0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Als2Q920R0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Als2Q920R0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Als2Q920R0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Als2Q920R0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Als2Q920R0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Als2Q920R0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Als2Q920R0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Als2Q920R0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Als2Q920R0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Als2Q920R0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Als2Q920R0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Als2Q920R0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Als2Q920R0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Als2Q920R0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Als2Q920R0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Als2Q920R0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Als2Q920R0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Als2Q920R0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Als2Q920R0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Als2Q920R0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Als2Q920R0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Als2Q920R0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Als2Q920R0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Als2Q920R0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Als2Q920R0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Als2Q920R0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Als2Q920R0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Als2Q920R0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Als2Q920R0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Als2Q920R0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Als2Q920R0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Als2Q920R0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
Als2Q920R0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Als2Q920R0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Als2Q920R0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Als2Q920R0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Als2Q920R0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Als2Q920R0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Als2Q920R0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Als2Q920R0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Als2Q920R0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Als2Q920R0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Als2Q920R0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Als2Q920R0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Als2Q920R0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Als2Q920R0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Als2Q920R0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Als2Q920R0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Als2Q920R0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Als2Q920R0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Als2Q920R0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Als2Q920R0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Als2Q920R0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Als2Q920R0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Als2Q920R0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Als2Q920R0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Als2Q920R0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Als2Q920R0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Als2Q920R0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Als2Q920R0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Als2Q920R0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Als2Q920R0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Als2Q920R0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Als2Q920R0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Als2Q920R0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Als2Q920R0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Als2Q920R0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Als2Q920R0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Als2Q920R0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Als2Q920R0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Als2Q920R0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Als2Q920R0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Als2Q920R0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Als2Q920R0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Als2Q920R0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Als2Q920R0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Als2Q920R0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Als2Q920R0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms